home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00652 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  36 lines
  1. ***********************************
  2. * Ribosomal protein L27 signature *
  3. ***********************************
  4.  
  5. Ribosomal protein L27 is one of the proteins from the large ribosomal subunit.
  6. L27  belongs to a family of ribosomal proteins which, on the basis of sequence
  7. similarities [1,2], groups:
  8.  
  9.  - Eubacterial L27.
  10.  - Red algal chloroplast L27.
  11.  - Plant chloroplast L27 (nuclear-encoded).
  12.  - Yeast mitochondrial YmL2 (gene MRPL2 or MRP7).
  13.  
  14. The schematic relationship between these groups of proteins is shown below.
  15.  
  16. Eub. L27                Nxxxxxxxxx
  17. Plant L27          tttttNxxxxxxxxxxxxx
  18. Algal L27              Nxxxxxxxxxx
  19. Yeast MRP7           tttNxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  20.                             ***
  21.  
  22. 't': transit peptide.
  23. 'N': N-terminal of mature protein.
  24. '*': position of the pattern.
  25.  
  26. -Consensus pattern: R-Q-R-G-T-K-x(3)-G-x-N-V-G-x-G-x-D
  27. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  28.  for Pyrobotrys stellata L27.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30. -Last update: June 1994 / Text revised.
  31.  
  32. [ 1] Elhag G.A., Bourque D.P.
  33.      Biochemistry 31:6856-6864(1992).
  34. [ 2] Otaka E., Hashimoto T., Mizuta K.
  35.      Protein Seq. Data Anal. 5:285-300(1993).
  36.